Modele de zimm

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Modele de zimm

Une manière graphique facile d`effectuer le raccord de données correspondant à la description donnée dans la section sur le rapport de Rayleigh est le complot dite de Zimm. Pour les petits et nous pouvons écrire de façon équivalente en mécanique statistique, le modèle Zimm – Bragg est un modèle de transition hélicoïdale qui décrit les transitions hélicoïdales des macromolécules, généralement des chaînes de polymères. La plupart des modèles fournissent une approximation raisonnable de l`hélicité fractionnaire d`un polypeptide donné; le modèle Zimm – Bragg diffère en incorporant la facilité de propagation (auto-réplication) par rapport à la nucléation. LS instruments a développé un logiciel Zimm Plot facile à utiliser qui peut traiter les données obtenues à partir d`expériences de diffusion de lumière statique appropriées pour calculer automatiquement le poids moléculaire, le rayon de la Gyration, et le deuxième coefficient de du viriel. Bruno Zimm a élaboré une extension importante pour inclure les interactions hydrodynamiques induites par le solvant entre les différentes parties de la chaîne en 1956. [2] alors que le modèle de Rouse surestime la diminution du coefficient de diffusion D avec le nombre de billes N comme 1/N, le modèle Zimm prédit D ~ 1/Nν qui est cohérent avec les données expérimentales pour les solutions de polymères dilués (où ν {displaystyle nu} est le Flory exposant). Le modèle Zimm – Bragg prend en considération la coopérativité de chaque segment lors du calcul de l`hélicité fractionnaire. La probabilité qu`un monomère donné soit une hélice ou une bobine est affectée par le monomère précédent; c`est-à-dire si le nouveau site est une nucléation ou une propagation. Le modèle Zimm – Bragg est équivalent à un modèle d`Ising unidimensionnel et n`a pas d`interactions à longue portée, c`est-à-dire des interactions entre les résidus bien séparés le long de l`épine dorsale; par conséquent, par le fameux argument de Rudolf Peierls, il ne peut pas subir une transition de phase. La mécanique statistique du modèle Zimm – Bragg [3] peut être résolue exactement en utilisant la méthode de transfert-matrice.

Les deux paramètres du modèle Zimm – Bragg sont σ, le poids statistique pour la nucléation d`une hélice et d`un s, le poids statistique pour la propagation d`une hélice. Ces paramètres peuvent dépendre du résidu j; par exemple, un résidu de proline peut facilement nucléer une hélice mais ne pas propager un; un résidu de leucine peut nucléer et propager facilement une hélice; que la glycine peut défavoriser à la fois la nucléation et la propagation d`une hélice. Étant donné que seules les interactions avec le voisin le plus proche sont prises en compte dans le modèle Zimm – Bragg, la fonction de partition complète pour une chaîne de N résidus peut être écrite comme suit ce document a été présenté au “Frühjahrstagung des Fachausschusses Polymerphysik der Deutschen Physikalischen Gesellschaft» à Kaiserslautern (Allemagne de l`Ouest), 12 – 14 mars 1986.

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